Η προγεστερόνη είναι μια ορμόνη που παίζει κεντρικό ρόλο στον κύκλο της εμμήνου ρύσεως και την αναπαραγωγική υγεία της γυναίκας. Εξασφαλίζει την κανονικότητα του κύκλου και έχει σημαντική επίδραση στην εμφάνιση και την διάρκεια της περιόδου. Η παραγωγή προγεστερόνης αυξάνεται μετά την ωορρηξία και βοηθά στην προετοιμασία της μήτρας για πιθανή εγκυμοσύνη. Αν δεν γίνει γονιμοποίηση του αυγού, τα επίπεδα προγεστερόνης μειώνονται, προκαλώντας την έναρξη της περιόδου.

Η προγεστερόνη επηρεάζει τον κύκλο με τον εξής τρόπο: μετά την ωορρηξία, το ωχρό σώμα (η δομή που δημιουργείται στην ωοθήκη μετά την απελευθέρωση του αυγού) αρχίζει να παράγει προγεστερόνη. Η ορμόνη αυτή ενισχύει την επένδυση της μήτρας, καθιστώντας την πιο έτοιμη να υποδεχτεί ένα έμβρυο. Αν δεν συμβεί εγκυμοσύνη, τα επίπεδα της προγεστερόνης πέφτουν, προκαλώντας την αποβολή της επένδυσης της μήτρας και την έναρξη της εμμηνόρροιας.

Αν τα επίπεδα προγεστερόνης είναι ανεπαρκή, μπορεί να προκαλέσουν ακανόνιστους κύκλους ή ατελή ωορρηξία. Σε κάποιες περιπτώσεις, αν η προγεστερόνη είναι πολύ χαμηλή, η περίοδος μπορεί να καθυστερήσει ή να γίνει πιο ελαφριά. Αντιθέτως, αν τα επίπεδα της προγεστερόνης είναι πολύ υψηλά, μπορεί να προκαλέσουν αιμορραγία ή να προκαλέσουν πρώιμη έναρξη της περιόδου. Η χρήση προγεστερόνης ως θεραπεία, για παράδειγμα, στα πλαίσια ορμονικής υποκατάστασης ή αντισύλληψης, μπορεί να επηρεάσει και αυτή τη διάρκεια και την ένταση της εμμήνου ρύσεως.