Γονότυπος: Η νέα μελέτη που δημοσιεύτηκε στο The Lancet Microbe αποκαλύπτει ότι η τεχνική ανιχνεύει νέες παραλλαγές σχεδόν μια εβδομάδα πιο γρήγορα από τις παραδοσιακές μεθόδους προσδιορισμού αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος.
Η τεχνολογία γονότυπου ανιχνεύει τις παραλλαγές του COVID πιο γρήγορα και φθηνά από ποτέ – σύμφωνα με έρευνα από το Πανεπιστήμιο της Ανατολικής Αγγλίας και την Υπηρεσία Ασφάλειας Υγείας του Ηνωμένου Βασιλείου. Η νέα μελέτη που δημοσιεύτηκε στο The Lancet Microbe αποκαλύπτει ότι η τεχνική ανιχνεύει νέες παραλλαγές σχεδόν μια εβδομάδα πιο γρήγορα από τις παραδοσιακές μεθόδους προσδιορισμού αλληλουχίας ολόκληρου του γονιδιώματος. Η ερευνητική ομάδα λέει ότι ο γονότυπος επέτρεψε την ταχύτερη ανίχνευση και κοινοποίηση των πληροφοριών για την παραλλαγή του COVID στους επαγγελματίες της πρώτης γραμμής προστασίας της υγείας στο απόγειο της πανδημίας. Είναι σημαντικό ότι βοήθησε στην ταχύτερη εφαρμογή τοπικών μέτρων ελέγχου, όπως ο εντοπισμός επαφών.
Ο επικεφαλής ερευνητής Καθ. Iain Lake, από τη Σχολή Περιβαλλοντικών Επιστημών της UEA, δήλωσε: “Όταν ξεκίνησε η πανδημία του COVID, η παραλλαγή με την οποία μολύνθηκαν οι άνθρωποι καθορίστηκε αρχικά χρησιμοποιώντας μια τεχνική υψηλής ακρίβειας γνωστή ως αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος. Αυτό είναι το χρυσό διαγνωστικό εργαλείο για τον εντοπισμό και τον γενετικό χαρακτηρισμό παραλλαγών.Όμως όπου μεγάλοι πληθυσμοί πρέπει να αξιολογηθούν γρήγορα—τότε το κόστος, η χωρητικότητα και η επικαιρότητα περιορίζουν τη χρησιμότητά του. “Μέχρι τις αρχές του 2021, νέα τεχνολογία για την ταχεία ανίχνευση νέων παραλλαγών δοκιμαζόταν από την κυβέρνηση στα εργαστήρια Test and Trace του NHS. Η τεχνολογία – γνωστή ως “δοκιμή γονότυπου” ή γονότυπος – επιτρέπει στους επιστήμονες να εξερευνήσουν γενετικές παραλλαγές.”
Ο Neil Bray, από την Υπηρεσία Ασφάλειας Υγείας του Ηνωμένου Βασιλείου (UKHSA), δήλωσε: «Θέλαμε να μάθουμε πώς αυτή η τεχνολογία συγκρίνεται με την παραδοσιακή αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος». Η ερευνητική ομάδα μελέτησε δεδομένα για περισσότερες από 115.000 περιπτώσεις όπου υπήρχαν διαθέσιμες πληροφορίες για την παραλλαγή του COVID τόσο από τον προσδιορισμό του γονότυπου όσο και από την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος. Συγκρίνοντας το αποτέλεσμα της παραλλαγής από τον προσδιορισμό του γονότυπου με το αποτέλεσμα από την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος, έδειξαν ότι τα αποτελέσματα γονότυπου ήταν πολύ ακριβή.
Ο καθηγητής Lake είπε: “Βρήκαμε ότι ο γονότυπος ήταν σε θέση να ανιχνεύσει γνωστές παραλλαγές COVID πιο γρήγορα και φθηνά από την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος. Παρήγαγαν αποτελέσματα παραλλαγής έξι ημέρες γρηγορότερα από την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος – με αποτελέσματα πίσω σε μόλις τρεις ημέρες, σε σύγκριση με εννέα ημέρες για την αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος.
Ο γονότυπος επέτρεψε μια εννιαπλάσια αύξηση στην ποσότητα των δειγμάτων που ελέγχθηκαν για παραλλαγές. Αυτό σήμαινε ότι ανιχνεύθηκαν παραλλαγές μεταξύ πολλών περισσότερων ατόμων. Τα τοπικά μέτρα ελέγχου, όπως η ιχνηλάτηση επαφών, θα μπορούσαν επομένως να πραγματοποιηθούν πιο γρήγορα. Ο γονότυπος μπορεί να εφαρμοστεί στην εύρεση παραλλαγών σε ευρύ φάσμα οργανισμών σε ανθρώπους και ζώα — επομένως έχει τεράστιες δυνατότητες για την καθοδήγηση της λήψης αποφάσεων για τη δημόσια υγεία και τον έλεγχο ασθενειών παγκοσμίως στο μέλλον.”
Η καθηγήτρια Σούζαν Χόπκινς, Επικεφαλής Ιατρικός Σύμβουλος του UKHSA, δήλωσε: «Η κορυφαία στον κόσμο τεχνογνωσία γονιδιωματικής από την οποία μπόρεσαν να αξιοποιήσουν το UKHSA και άλλα ιδρύματα σε όλο το Ηνωμένο Βασίλειο καθ’ όλη τη διάρκεια της πανδημίας ήταν κρίσιμης σημασίας για την ανταπόκριση του Ηνωμένου Βασιλείου στον COVID-19. Η έρευνα όπως αυτή θα βοηθήσει συνεχίζουμε να χτίζουμε πάνω στις δυνατότητές μας σε αυτόν τον τομέα και να διασφαλίσουμε ότι το Ηνωμένο Βασίλειο είναι όσο το δυνατόν καλύτερα προετοιμασμένο για να ανταποκριθεί γρήγορα σε αναδυόμενες απειλές για τη δημόσια υγεία στο μέλλον».
Η καθηγήτρια Dame Anna Dominiczak, Επικεφαλής Επιστήμονας για την Υγεία στη Σκωτία, η οποία προηγουμένως ηγήθηκε της επιχείρησης της κυβέρνησης του Ηνωμένου Βασιλείου για την επέκταση και τη λειτουργία των εργαστηρίων φάρων για τον COVID, δήλωσε: «Έρευνες όπως αυτή είναι πολύ σημαντικές για να διασφαλίσουμε ότι αξιοποιούμε τις τεράστιες προόδους στις δοκιμές που συνέβησαν κατά τη διάρκεια του COVID για να ενισχύσουμε την άμυνά μας έναντι μελλοντικών απειλών πανδημίας».
Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο Google News και μάθετε πρώτοι όλες τις ειδήσεις
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο κανάλι μας στο YouTube
