DNA: Προηγούμενες μελέτες γενετικής συσχέτισης ατόμων με ευρωπαϊκή καταγωγή μπορεί να είναι ανακριβείς

Ενώ οι διαφορές στο γονιδίωμα δύο ανθρώπων είναι μικρότερες από 1%, το μικρό ποσοστό γονιδιωματικής παραλλαγής μπορεί να δώσει ενδείξεις για το από πού μπορεί να προέρχονται οι πρόγονοι ενός ατόμου και πώς μπορεί να σχετίζονται διαφορετικές οικογένειες.

DNA: Ερευνητές διαπίστωσαν ότι προηγούμενες μελέτες που ανέλυαν τα γονιδιώματα ατόμων με ευρωπαϊκή καταγωγή ενδέχεται να έχουν αναφέρει ανακριβή αποτελέσματα, καθώς δεν είχαν λάβει πλήρως υπόψη τους τη δομή του πληθυσμού. Λαμβάνοντας υπόψη τις μικτές γενετικές γραμμές, οι ερευνητές του Εθνικού Ινστιτούτου Ερευνών Ανθρώπινου Γονιδιώματος (NHGRI), που ανήκει στα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας, έδειξαν ότι οι προηγούμενες συμπερασματικές συνδέσεις μεταξύ μιας γονιδιωματικής παραλλαγής που βοηθά στην πέψη της λακτόζης και χαρακτηριστικών όπως το ύψος και το επίπεδο χοληστερόλης ενός ατόμου μπορεί να μην είναι έγκυρες.

Η μελέτη, η οποία δημοσιεύθηκε στο Nature Communications, δείχνει ότι τα άτομα με ευρωπαϊκή καταγωγή, τα οποία προηγουμένως αντιμετωπίζονταν ως γενετικά ομοιογενής ομάδα σε γενετικές μελέτες μεγάλης κλίμακας, έχουν σαφείς ενδείξεις για μικτές γενετικές γραμμές, γνωστές ως προσμίξεις. Ως εκ τούτου, τα αποτελέσματα από προηγούμενες μελέτες συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος που δεν λαμβάνουν υπόψη τους την πρόσμιξη στις εξετάσεις των ατόμων με ευρωπαϊκή καταγωγή θα πρέπει να επανεκτιμηθούν. “Διαβάζοντας έγγραφα γενετικής του πληθυσμού, συνειδητοποιήσαμε ότι το πρότυπο της γενετικής σύνθεσης στην Ευρώπη είναι πολύ λεπτομερές για να το δούμε σε ηπειρωτικό επίπεδο”, δήλωσε ο Daniel Shriner, Ph.D., επιτελικός επιστήμονας στο Κέντρο Έρευνας για τη Γονιδιωματική και την Παγκόσμια Υγεία του Εθνικού Ινστιτούτου Υγείας NIH και κύριος συγγραφέας της μελέτης. “Αυτό που είναι σαφές με βάση την ανάλυσή μας, είναι ότι όταν αξιολογούνται δεδομένα από μελέτες γενετικής συσχέτισης ατόμων ευρωπαϊκής καταγωγής, οι ερευνητές θα πρέπει να προσαρμόζουν την πρόσμιξη στον πληθυσμό για να αποκαλύψουν πραγματικές συνδέσεις μεταξύ γονιδιωματικών παραλλαγών και χαρακτηριστικών”. Για να εξετάσουν την ευρωπαϊκή γενετική καταγωγή, οι ερευνητές συγκέντρωσαν δεδομένα από δημοσιευμένες μελέτες γενετικής συσχέτισης και δημιούργησαν ένα πάνελ αναφοράς γονιδιωματικών δεδομένων που περιλάμβανε 19.000 άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής σε 79 πληθυσμούς στην Ευρώπη και Ευρωπαίους Αμερικανούς στις ΗΠΑ, αποτυπώνοντας την προγονική ποικιλομορφία που δεν παρατηρείται σε άλλους μεγάλους καταλόγους ανθρώπινης γονιδιωματικής παραλλαγής. Ως παράδειγμα, οι ερευνητές διερεύνησαν το γονίδιο της λακτάσης, το οποίο κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη που βοηθά στην πέψη της λακτόζης και παρουσιάζει μεγάλη ποικιλομορφία στην Ευρώπη. Χρησιμοποιώντας τον νέο πίνακα αναφοράς, ανέλυσαν πώς μια γονιδιωματική παραλλαγή του γονιδίου της λακτάσης σχετίζεται με χαρακτηριστικά όπως το ύψος, ο δείκτης μάζας σώματος και η χοληστερόλη λιποπρωτεϊνών χαμηλής πυκνότητας, γνωστή και ως “κακή χοληστερόλη”. Όταν οι ερευνητές έλαβαν υπόψη τους τη γενετική πρόσμιξη του ευρωπαϊκού πληθυσμού στην ανάλυσή τους, διαπίστωσαν ότι η γονιδιωματική παραλλαγή που δίνει στους ανθρώπους την ικανότητα να χωνεύουν τη λακτόζη δεν συνδέεται με το ύψος ή το επίπεδο της χοληστερόλης λιποπρωτεΐνης χαμηλής πυκνότητας. Αντίθετα, η ίδια παραλλαγή επηρεάζει τον δείκτη μάζας σώματος. “Τα ευρήματα αυτής της μελέτης υπογραμμίζουν τη σημασία της εκτίμησης ότι η πλειονότητα των ατόμων σε πληθυσμούς σε όλο τον κόσμο έχουν μικτό προγονικό υπόβαθρο και ότι η συνεκτίμηση αυτών των πολύπλοκων προγονικών υποβάθρων είναι εξαιρετικά σημαντική στις γενετικές μελέτες και στην πρακτική της γονιδιωματικής ιατρικής”, λέει ο Charles Rotimi, Ph.D., διακεκριμένος ερευνητής του NIH, διευθυντής του Κέντρου Έρευνας για τη Γονιδιωματική και την Παγκόσμια Υγεία και κύριος συγγραφέας της μελέτης. Ενώ το γονίδιο της λακτάσης είναι ένα παράδειγμα γονιδίου που μπορεί να συνδέεται λανθασμένα με ορισμένα χαρακτηριστικά με βάση προηγούμενες αναλύσεις, οι ερευνητές λένε ότι είναι πιθανό να υπάρχουν και άλλες λανθασμένες συσχετίσεις στη βιβλιογραφία και ότι κάποιες πραγματικές συσχετίσεις δεν έχουν ακόμη βρεθεί. Οι πληροφορίες σχετικά με τον τρόπο με τον οποίο οι γονιδιωματικές παραλλαγές σχετίζονται με διάφορα χαρακτηριστικά βοηθούν τους ερευνητές να εκτιμήσουν τις πολυγονιδιακές βαθμολογίες κινδύνου και μπορεί να δώσουν ενδείξεις σχετικά με την ικανότητα ενός ατόμου να ανταποκριθεί με ασφάλεια σε φαρμακευτικές θεραπείες.

Ενώ οι διαφορές στο γονιδίωμα δύο ανθρώπων είναι μικρότερες από 1%, το μικρό ποσοστό γονιδιωματικής παραλλαγής μπορεί να δώσει ενδείξεις για το από πού μπορεί να προέρχονται οι πρόγονοι ενός ατόμου και πώς μπορεί να σχετίζονται διαφορετικές οικογένειες. Οι πληροφορίες σχετικά με το από ποιον κατάγεται βιολογικά ένα άτομο, γνωστές ως γενετική καταγωγή, μπορούν να δώσουν σημαντικές ενδείξεις σχετικά με τους γενετικούς κινδύνους για κοινές ασθένειες. “Η εύρεση πραγματικών γενετικών συσχετίσεων θα βοηθήσει τους ερευνητές να είναι πιο αποτελεσματικοί και προσεκτικοί με τον τρόπο διεξαγωγής περαιτέρω έρευνας”, δήλωσε ο Mateus Gouveia, Ph.D., ερευνητής στο Κέντρο Έρευνας για τη Γονιδιωματική και την Παγκόσμια Υγεία και πρώτος συγγραφέας της μελέτης. “Ελπίζουμε ότι με τη συνεκτίμηση των μικτών γενεαλογικών καταβολών σε μελλοντικές γονιδιωματικές αναλύσεις, μπορούμε να βελτιώσουμε την προγνωστική αξία των πολυγονιδιακών βαθμολογιών κινδύνου και να διευκολύνουμε τη γονιδιωματική ιατρική”. Ο πίνακας αναφοράς που δημιουργήθηκε σε αυτή τη μελέτη είναι διαθέσιμος στην επιστημονική κοινότητα για χρήση σε άλλες μελέτες, με πρόσθετες πληροφορίες που παρέχονται στην εργασία.

Γενετικές σχέσεις μεταξύ της σχιζοφρένειας και της καρδιαγγειακής νόσου

Ερευνητές εντοπίζουν σπάνιες παραλλαγές γονιδίων για κληρονομική τριχόπτωση στους άνδρες

Η σχιζοφρένεια σχετίζεται με σωματικές μεταλλάξεις που συμβαίνουν στη μήτρα, δείχνει μελέτη

Πώς σχετίζεται μια γενετική παραλλαγή με την εξέλιξη της Σκλήρυνσης Κατά Πλάκας;