Search Icon
ΑΝΑΖΗΤΗΣΗ
Τεχνολογία

Κορωνοϊός βάση δεδομένων: Διαδικτυακή πλατφόρμα “όπλο” στα χέρια των επιστημόνων

Κορωνοϊός βάση δεδομένων: Διαδικτυακή πλατφόρμα “όπλο” στα χέρια των επιστημόνων


Κορωνοϊός βάση δεδομένων: Οι ερευνητές σε όλο τον κόσμο είναι ένα βήμα πιο κοντά στην καλύτερη κατανόηση των περιπλοκών του COVID-19 χάρη σε δύο νέους ιστότοπους που αναπτύχθηκαν από ερευνητές στο Baylor College of Medicine και το Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια Σαν Ντιέγκο. Οι πόροι είναι ελεύθερα διαθέσιμοι μέσω του έργου Signaling Pathways (Baylor) και του Network Data Exchange (UCSD). Συμβάλλουν πολύ θετικά στη μελέτη της νόσου δίνοντας πληροφορίες στους ερευνητές σχετικά με τα κυτταρικά γονίδια των οποίων η έκφραση επηρεάζεται από λοίμωξη από κορωνοϊό και τοποθετούν αυτά τα σημεία δεδομένων στο πλαίσιο του σύνθετου δικτύου των μοριακών οδών σηματοδότησης ξενιστή. Η χρήση αυτού του πόρου έχει τη δυνατότητα να επιταχύνει την ανάπτυξη νέων θεραπευτικών στρατηγικών. Η μελέτη δημοσιεύεται στο περιοδικό Scientific Data.

“Το κίνητρό μας για την ανάπτυξη αυτού του πόρου είναι να συμβάλουμε στο να κάνουμε την έρευνα σχετικά με το COVID-19 πιο προσιτή στην επιστημονική κοινότητα. Όταν οι ερευνητές έχουν ανοιχτή πρόσβαση στο έργο του άλλου, οι ανακαλύψεις προχωρούν πιο αποτελεσματικά”, δήλωσε ο κύριος συγγραφέας Dr. Neil McKenna, συνεργάτης καθηγητής μοριακής και κυτταρικής βιολογίας και μέλος του Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center στο Baylor. Εδώ και χρόνια, η επιστημονική κοινότητα δημιουργεί και αρχειοθετεί μοριακά σύνολα δεδομένων που τεκμηριώνουν πώς τα γονίδια εκφράζονται καθώς τα κύτταρα ασκούν τις φυσιολογικές τους λειτουργίες ή σε συνδυασμό με ασθένειες. Ωστόσο, συνήθως αυτές οι πληροφορίες δεν είναι εύκολα προσβάσιμες.


Το 2019, ο McKenna και οι συνάδελφοί του ανέπτυξαν το Signaling Pathways Project, μια διαδικτυακή πλατφόρμα που ενσωματώνει μοριακά σύνολα δεδομένων που δημοσιεύονται στην επιστημονική βιβλιογραφία σε συναίνεση ρυθμιστικών υπογραφών ή σε αυτό που ονομάζουν συναινετικά, τα οποία ταξινομούν τα γονίδια σύμφωνα με τους ρυθμούς διαφορικής έκφρασης. Στην τρέχουσα μελέτη, οι ερευνητές δημιούργησαν συναινετικά γονίδια που έχουν προσβληθεί από λοίμωξη με τρεις κύριους κοροναϊούς, το στεφανιαίο σύνδρομο του αναπνευστικού μέσου της Μέσης Ανατολής (MERS) και το σοβαρό οξύ αναπνευστικό σύνδρομο κορωνοϊούς 1 (SARS1) και 2 (SARS2, που προκαλεί το COVID-19).

corona.jpg

Ο McKenna και οι συνεργάτες του παρέχουν έναν πόρο που βοηθά τους ερευνητές να αξιοποιήσουν στο έπακρο τα σύνολα δεδομένων του coronavirus. Ο πόρος προσδιορίζει τα γονίδια των οποίων η έκφραση επηρεάζεται πιο σταθερά από τη μόλυνση και ενσωματώνει αυτές τις αποκρίσεις με δεδομένα σχετικά με τις οδούς μοριακής σηματοδότησης των κυττάρων, με μια έννοια να πάρει μια καλύτερη εικόνα για το τι συμβαίνει μέσα σε ένα κύτταρο που έχει μολυνθεί από κορωνοϊό και πώς ανταποκρίνεται το κύτταρο. “Η συνεργασία με το UCSD καθιστά τις αναλύσεις μας διαθέσιμες ως διαισθητικά δίκτυα τύπου Cytoscape”, λέει ο McKenna. “Επειδή η χρήση αυτών των πόρων δεν απαιτεί εκπαίδευση στη μετα-ανάλυση, μειώνουν σημαντικά τα εμπόδια στη χρηστικότητα από ερευνητές πάγκων.”

Παροχή νέων πληροφοριών για το COVID-19

Η στρατηγική συναίνεσης, εξηγούν οι ερευνητές, μπορεί να αποκαλύψει προηγουμένως μη αναγνωρισμένους δεσμούς ή να παράσχει περαιτέρω υποστήριξη για ύποπτες συνδέσεις μεταξύ λοίμωξης από κορωνοϊό και οδών ανθρώπινης σηματοδότησης, απλοποιώντας τελικά τη δημιουργία υποθέσεων που θα δοκιμαστούν στο εργαστήριο. Για παράδειγμα, η σχέση μεταξύ εγκυμοσύνης και ευαισθησίας στο COVID-19 ήταν δύσκολο να εκτιμηθεί λόγω της έλλειψης κλινικών δεδομένων, αλλά η προσέγγιση του McKenna και των συναδέλφων του έδωσε νέες γνώσεις σε αυτό το παζλ.

“Βρήκαμε ενδείξεις ότι η σηματοδότηση υποδοχέα προγεστερόνης ανταγωνίζεται την προκαλούμενη από SARS2 φλεγμονώδη σηματοδότηση που προκαλείται από ιντερφερόνη στο επιθήλιο των αεραγωγών. Αυτό το εύρημα υποδηλώνει την υπόθεση ότι η καταστολή της απόκρισης ιντερφερόνης στη μόλυνση από SARS2 από αυξημένη κυκλοφορούσα προγεστερόνη κατά τη διάρκεια της εγκυμοσύνης μπορεί να συμβάλει στην ασυμπτωματική κλινική πορεία” επισήμανε ο McKenna. Σύμφωνα με την υπόθεσή τους, ενώ αυτό το έγγραφο ήταν υπό εξέταση, ξεκίνησε μια κλινική δοκιμή για την αξιολόγηση της προγεστερόνης ως θεραπείας για το COVID-19 σε άνδρες.

diadiktyo.jpg

 

 

Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο Google News και μάθετε πρώτοι όλες τις ειδήσεις
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο κανάλι μας στο YouTube

Διαβάστε Eπίσης:

Καινοτόμα αιματολογικά τεστ: Μια νέα πνοή στην ιατρική φροντίδα

Νέα μέθοδος ανάπτυξης αιμοφόρων αγγείων σε εργαστηριακά οργανοειδή 

svg%3E svg%3E
svg%3E
Αφιέρωμα στον Διαβήτη healthwebgr svg%3E
Περισσότερα

Τεχνητή νοημοσύνη: Μπορεί να βοηθήσει στην ανίχνευση εγκεφαλικών όγκων;

Τεχνητή νοημοσύνη: Οι ακτινολόγοι βρίσκονται μπροστά σε μια σημαντική επανάσταση στον τομέα της ιατρικής απεικόνισης, καθώς η τεχνητή νοημοσύνη αναμένεται να παίξει καθοριστικό ρόλο στην ανίχνευση εγκεφαλικών όγκων.

Νευρωνική διεπαφή: Πρόσβαση στον εγκέφαλο χωρίς επεμβατική χειρουργική

Νευρωνική διεπαφή: Οι τελευταίες εξελίξεις στην ιατρική τεχνολογία οδήγησαν στην ανάπτυξη μιας νέας ελάχιστα επεμβατικής νευρωνικής διεπαφής που υπόσχεται να αλλάξει δραστικά τον τρόπο αλληλεπίδρασης με τον εγκέφαλο.

Η τεχνική που επαναπροσδιορίζει τη µεταµόσχευση οργάνων 

Ένα από τα πιο υποσχόμενα πεδία έρευνας είναι η βιολογία των βλαστοκυττάρων. Τα βλαστοκύτταρα έχουν την ικανότητα να διαφοροποιούνται σε πολλούς τύπους κυττάρων και μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την αναγέννηση κατεστραμμένων οργάνων ή ιστών.

Νέο σύστημα φακών για ενδοσκόπια επιτρέπει στους γιατρούς να δουν μέσα στο σώμα όπως ποτέ άλλοτε

Ενδοσκόπιο: Έχει σχεδιαστεί ένα νέο είδος συστήματος φακών για την άκρη ενός ενδοσκοπίου, το οποίο θα μπορούσε να επιτρέψει στους γιατρούς να βλέπουν και να θεραπεύουν περιοχές βαθιά μέσα στο σώμα.

Ρομποτική χειρουργική: Ο νέος τρόπος αντιμετώπισης της πρόπτωσης μήτρας

Ρομποτική χειρουργική: Η πρόπτωση της μήτρας, όπου η μήτρα υποχωρεί από τη φυσική της θέση και κατέρχεται στον κόλπο, είναι μια συχνή κατάσταση που επηρεάζει πολλές γυναίκες, ειδικά εκείνες που έχουν υποβληθεί σε τοκετούς.

Τεχνητή νοημοσύνη: Ο νέος σύμμαχος στην ανίχνευση καρκινικών όγκων εγκεφάλου

Τεχνητή νοημοσύνη: Ένα επαναστατικό μοντέλο τεχνητής νοημοσύνης έχει αναπτυχθεί για τον εντοπισμό καρκινικών όγκων στον εγκέφαλο με απίστευτη ταχύτητα και ακρίβεια.

Γονιδιακή θεραπεία: Δίνει νέα ζωή σε παιδιά με σπάνια σπονδυλική πάθηση

Γονιδιακή θεραπεία: Μια καινοτόμος νέα θεραπεία προσφέρει ελπίδα σε παιδιά που πάσχουν από μια σπάνια πάθηση της σπονδυλικής στήλης, βοηθώντας τα να ανακτήσουν την ικανότητα να περπατούν.

Close Icon