Βακτήρια: Ερευνητές στο Ινστιτούτο Καρκίνου της Ολλανδίας συνέταξαν έναν λεπτομερή κατάλογο βακτηρίων που ζουν σε μεταστάσεις καρκίνου. Έχοντας αναλύσει περισσότερους από 4.000 όγκους, έριξαν φως στην ποικιλομορφία αυτών των κατοίκων και στο πώς θα μπορούσαν να αλληλεπιδράσουν με τα καρκινικά κύτταρα και το περιβάλλον τους.
Για παράδειγμα, ορισμένα βακτήρια συνδέθηκαν με χειρότερη απόκριση στην ανοσοθεραπεία. Αυτή η μελέτη ανοίγει το δρόμο για μια καλύτερη κατανόηση του πώς τα βακτήρια βοηθούν ή εμποδίζουν τον καρκίνο (θεραπεία) και πώς μπορούμε να το χρησιμοποιήσουμε αυτό προς όφελος των ασθενών, λένε οι ερευνητές που δημοσίευσαν τα ευρήματά τους στο περιοδικό Cell. Πάνω και μέσα στο σώμα μας ζουν δισεκατομμύρια μικροοργανισμοί: βακτήρια, ιοί και ζυμομύκητες – το μικροβίωμα μας. Τους χρειαζόμαστε και μας χρειάζονται. Τα βακτήρια μας βοηθούν να αφομοιώσουμε την τροφή μας, για παράδειγμα, και να συνεργάζονται με το ανοσοποιητικό μας σύστημα στην καταπολέμηση των παθογόνων μικροοργανισμών. Ειδικότερα, τα βακτήρια του εντέρου έχουν μελετηθεί εκτενώς, μεταξύ άλλων στο πλαίσιο του καρκίνου. Για παράδειγμα, μπορούν να επηρεάσουν την αποτελεσματικότητα της ανοσοθεραπείας και της χημειοθεραπείας. Αλλά αυτοί οι μικροσκοπικοί συγκάτοικοι στεγάζονται και έξω από το έντερο. Τα βακτήρια βρίσκονται σε όγκους, για παράδειγμα. Με νέες τεχνικές, οι ερευνητές βελτιώνονται στο να ανακαλύπτουν ποια μικρόβια είναι. Αλλά το πώς τα βακτήρια φτάνουν σε έναν όγκο και τι ακριβώς κάνουν εκεί παραμένει σε μεγάλο βαθμό άγνωστο, καθιστώντας ασαφές πόσο σημαντικά είναι για την ασθένεια και την επίδραση των θεραπειών.
26 τύποι καρκίνου
Επειδή πολλοί ασθενείς τελικά πεθαίνουν από μεταστάσεις και πολλές θεραπείες τους στοχεύουν, οι ερευνητικές ομάδες του Emile Voest και του Lodewyk Wessels εξέτασαν πιο προσεκτικά αυτές τις μεταστάσεις. Εξάλλου, λίγα ήταν γνωστά για τα βακτήρια σε αυτούς τους όγκους. Μαζί με τους συναδέλφους τους, μεταξύ άλλων, στο Ολλανδικό Ινστιτούτο Καρκίνου και το Ινστιτούτο Oncode έχουν τώρα χαρτογραφήσει ποια βακτήρια υπάρχουν στις μεταστάσεις του καρκίνου. Σε ιστό από περισσότερες από 4.000 μεταστάσεις 26 τύπων καρκίνου, οι ερευνητές ανέλυσαν τον κώδικα του υπάρχοντος DNA. Από αυτό το γενετικό υλικό μπορείτε να δείτε όχι μόνο ποια ανθρώπινα κύτταρα υπάρχουν εκεί, αλλά και ποια βακτήρια—επειδή και αυτά έχουν DNA. Για το σκοπό αυτό χρησιμοποίησαν κλινικές πληροφορίες και δεδομένα DNA που δημιουργήθηκαν από το Ιατρικό Ίδρυμα Hartwig. Με αυτό το αφάνταστα μεγάλο βουνό πληροφοριών (400 terabytes), χρησιμοποίησαν την ισχύ του υπολογιστή για να καταλάβουν ποια βακτήρια συγκεντρώνονται σε ποια μέρη. Αυτό απαιτούσε πολύ έξυπνο προγραμματισμό, επειδή υπάρχει σχετικά λίγο βακτηριακό DNA σε ένα τέτοιο κομμάτι ιστού. «Περίεργα, δεν είναι μόνο οι μεταστάσεις από τον καρκίνο του παχέος εντέρου που περιέχουν πολλά βακτήρια», λέει ο ερευνητής Thomas Battaglia. Κάποιος θα μπορούσε να το περίμενε επειδή τα περισσότερα από τα βακτήριά μας βρίσκονται στο κόλον, από όπου θα μπορούσαν ενδεχομένως να ταξιδέψουν κατά τη διάρκεια της μετάστασης σε άλλα σημεία του σώματος. «Επίσης, ποια βακτήρια υπάρχουν σε μια μετάσταση σχετίζεται στενά με τη θέση στο σώμα, τις συνθήκες εκεί και τον τύπο του καρκίνου».
Απόκριση θεραπείας
Ανακάλυψαν επίσης μια σχέση μεταξύ των βακτηρίων και της αποτελεσματικότητας της θεραπείας. Ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και Fusobacterium στη μετάστασή τους, για παράδειγμα, ανταποκρίθηκαν χειρότερα στην ανοσοθεραπεία από τους συνομηλίκους τους χωρίς αυτό το βακτήριο. Ο Τόμας είπε, «Παρατηρήσαμε επίσης ότι όσο πιο ποικιλόμορφη είναι η βακτηριακή κοινότητα, τόσο πιο ενεργά είναι τα γειτονικά καρκινικά κύτταρα». «Η δουλειά μας ανοίγει πόρτες για την εξερεύνηση νέων μορφών θεραπειών, για παράδειγμα κατά των βακτηρίων που μπορεί να βοηθήσουν τον όγκο», λέει η συν-συγγραφέας Iris Mimpen. «Μας βοηθά να κατανοήσουμε πώς λειτουργεί το περίπλοκο περιβάλλον των όγκων, ένα περιβάλλον στο οποίο όλα τα είδη κυττάρων – συμπεριλαμβανομένων των βακτηρίων – ζουν μαζί και επηρεάζουν το ένα το άλλο».