SARS-CoV-2: Για να κατανοήσουν καλύτερα την εξάπλωση του COVID-19 κατά τη διάρκεια της πανδημίας, οι αξιωματούχοι της δημόσιας υγείας έχουν επεκτείνει την επιτήρηση των λυμάτων. Αυτές οι προσπάθειες παρακολουθούν τα επίπεδα του SARS-CoV-2 και τους κινδύνους για την υγεία μεταξύ των περισσότερων ανθρώπων, αλλά τους λείπουν άτομα που ζουν χωρίς στέγη, έναν πληθυσμό ιδιαίτερα ευάλωτο σε σοβαρή μόλυνση.
Για να καλύψουν αυτό το κενό πληροφοριών, ερευνητές που αναφέρουν στο Environmental Science & Technology Letters δοκίμασαν υδάτινες οδούς ελέγχου πλημμυρών κοντά σε καταυλισμούς χωρίς στέγη, βρίσκοντας παρόμοια μοτίβα μετάδοσης όπως στην ευρύτερη κοινότητα και εντοπίζοντας ιικές μεταλλάξεις που δεν είχαν παρατηρηθεί προηγουμένως. Τα τελευταία χρόνια, η δοκιμή ακατέργαστων λυμάτων για τη συχνότητα εμφάνισης του SARS-CoV-2 και τις κυρίαρχες παραλλαγές του ιού, καθώς και άλλα παθογόνα, ήταν ζωτικής σημασίας για να βοηθηθούν οι υπεύθυνοι δημόσιας υγείας να προσδιορίσουν τη μετάδοση μολυσματικών ασθενειών στις τοπικές κοινότητες. Ωστόσο, αυτή η παρακολούθηση συλλαμβάνει μόνο πληροφορίες για ιούς που αποβάλλονται από ανθρώπινα κόπρανα και ούρα σε κτίρια που είναι συνδεδεμένα με την τοπική υποδομή αποχέτευσης. Πέρα από τον αντίκτυπο της πανδημίας στην ανθρώπινη υγεία, επιδείνωσε επίσης τις κοινωνικοοικονομικές δυσκολίες και αύξησε τον αριθμό των ανθρώπων που βιώνουν έλλειψη στέγης και ζουν σε υπαίθριους καταυλισμούς χωρίς πρόσβαση σε εσωτερικά μπάνια. Για να κατανοήσουν τον επιπολασμό του COVID-19 μεταξύ των ανθρώπων που ζουν χωρίς προστασία, ο Edwin Oh και οι συνεργάτες του έκαναν τεστ για SARS-CoV-2 σε πλωτές οδούς κοντά σε καταυλισμούς έξω από το Λας Βέγκας από τον Δεκέμβριο του 2021 έως τον Ιούλιο του 2022. Χρησιμοποιώντας ποσοτική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης, οι ερευνητές αναγνώρισαν το RNA του SARS-CoV-2 σε περισσότερο από το 25% των δειγμάτων που δοκιμάστηκαν από δύο κανάλια ελέγχου πλημμυρών.
Η υψηλότερη συχνότητα ανίχνευσης κατά την περίοδο της μελέτης ευθυγραμμίστηκε με το πρώτο κύμα λοιμώξεων παραλλαγής omicron του Λας Βέγκας, όπως επιβεβαιώθηκε μέσω παράλληλων δοκιμών σε τοπική μονάδα επεξεργασίας λυμάτων. Οι ερευνητές λένε ότι αυτά τα αποτελέσματα υποδηλώνουν ότι παρόμοιο επίπεδο μετάδοσης συνέβαινε εντός της μη προστατευμένης κοινότητας όπως και στον γενικό πληθυσμό. Στη συνέχεια, οι ερευνητές διεξήγαγαν αλληλουχία ολόκληρου του γονιδιώματος για να εντοπίσουν τις παραλλαγές του SARS-CoV-2 στις πλωτές οδούς. Αυτά τα δείγματα περιείχαν σε μεγάλο βαθμό τις ίδιες παραλλαγές που εντοπίστηκαν στην ευρύτερη κοινότητα. Η βαθύτερη υπολογιστική ανάλυση των ιικών αλληλουχιών εντόπισε τρεις νέες μεταλλάξεις ιικής πρωτεΐνης ακίδας σε ορισμένα δείγματα υδάτινων οδών, αλλά οι ερευνητές δεν έχουν ακόμη εξετάσει τον αντίκτυπο που μπορεί να έχουν αυτές οι μεταλλάξεις στη λειτουργία του ιού ή στα κλινικά αποτελέσματα. Ανεξάρτητα από αυτό, η ικανότητα ανίχνευσης και αναγνώρισης του SARS-CoV-2 σε περιβαλλοντικά δείγματα νερού θα μπορούσε να βοηθήσει στη βελτίωση των μέτρων δημόσιας υγείας για μια κοινότητα που συχνά υποεκπροσωπείται στις τρέχουσες μεθόδους επιτήρησης. Οι ερευνητές λένε επίσης ότι η παρακολούθηση των υδάτινων οδών θα μπορούσε να προειδοποιήσει τους υγειονομικούς αξιωματούχους για απροσδόκητες παραλλαγές που κυκλοφορούν στην κοινότητα.
