Ολοκληρώθηκε από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2, που λειτουργεί υπό το συντονισμό του ΕΟΔΥ, η γονιδιωματική ανάλυση σε 895 δείγματα που έχουν επιλεγεί τυχαιοποιημένα ή στοχευμένα και αφορούν στην περίοδο 11 Δεκεμβρίου 2021 έως 10 Ιανουαρίου 2022. Από τον έλεγχο των 895 δειγμάτων, αναδείχθηκαν συνολικά 885 δείγματα με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος (Variants Of Concern – VOC).
Εκ των 885 δειγμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος, τα 665 αφορούν στο Omicron και 220 αφορούν στο στέλεχος Delta (Πίνακας 3). Τέσσερα εκ των 220 στελεχών Delta αφορούν στο στέλεχος Α.Υ.4.2, τα οποία εντοπίστηκαν σε εγχώρια κρούσματα στις Περιφερειακές Ενότητες του Βορείου Τομέα Αθηνών (1), του Λασιθίου (2) και της Λέσβου (1). Από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα έχουν ελεγχθεί στην επικράτεια συνολικά 44.763 δείγματα από εγχώρια κρούσματα.
Εξ αυτών 40.369 προέρχονται από τυχαία επιλογή δειγμάτων, 3.653 προέρχονται από στοχευμένη λήψη ή επιλογή δειγμάτων και για 741 δείγματα δεν είναι διαθέσιμος ο τρόπος επιλογής. Κατά τη διάρκεια του διμήνου πριν τις 10 Ιανουαρίου 2022, έχουν ελεγχθεί στην επικράτεια συνολικά 7.613 δείγματα από εγχώρια κρούσματα. Εξ αυτών 7.451 προέρχονται από τυχαία επιλογή δειγμάτων και 162 προέρχονται από στοχευμένη λήψη ή επιλογή δειγμάτων.
Μεταξύ των 7.451 τυχαία επιλεγμένων δειγμάτων στην επικράτεια που αφορούν το δίμηνο πριν τις 10 Ιανουαρίου 2022, τα δύο πιο συχνά στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος που έχουν απομονωθεί είναι το Delta με ποσοστό 83,75%, ακολουθούμενο από το Omicron με ποσοστό 16,24% (Πίνακας 4).
Μεταξύ των 162 δειγμάτων που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα κατά τη διάρκεια του διμήνου πριν τις 10 Ιανουαρίου 2022, 57,41% αφορούν στο στέλεχος Omicron και 42,59% στο στέλεχος Delta. Επιπλέον, έχουν απομονωθεί συνολικά 563 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος από δείγματα εισαγόμενων κρουσμάτων, εκ των οποίων 331 αφορούν στο Delta, 113 στο Alpha, 98 στο Omicron, 7 στο Mu, 6 στο Beta, 4 στο B.1.1.318 (Variant E484K), 1 στο Eta, 1 στο C.36, 1 στο Kappa, 1 στο B.1.1 (Variant E484K).
Η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας των αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών μέχρι και την εβδομάδα 52 του 2021 απεικονίζεται στο Διάγραμμα 9 ενώ δίνονται επιπλέον προσωρινά στοιχεία για τις εβδομάδες 01 και 02 του 2022. Όσον αφορά στα στελέχη ενδιαφέροντος που χρήζουν άμεσης λήψης μέτρων ελέγχου επί του παρόντος στη χώρα, η γεωγραφική κατανομή ανά Περιφερειακή Ενότητα παρουσιάζεται στον πίνακα 5.
Πίνακας 3: Απόλυτη και σχετική συχνότητα κρουσμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος/υπό διερεύνηση/υπό παρακολούθηση ή άλλα στελέχη ενδιαφέροντος του ιού SARS CoV-2 από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα.
