Search Icon
ΑΝΑΖΗΤΗΣΗ
Ρεπορτάζ Υγείας

Γονιδιωματικός χαρακτηρισμός της επιδημίας Έμπολα το 2020

Γονιδιωματικός χαρακτηρισμός της επιδημίας Έμπολα το 2020

Η κατανόηση των συνδέσεων μεταξύ των κρουσμάτων Έμπολα στη Λαϊκή Δημοκρατία του Κονγκό παρουσιάζει σημαντικές προκλήσεις λόγω της τεράστιας γεωγραφικής εξάπλωσης σε ολόκληρη τη χώρα.


Οι ερευνητές επιδημιολογίας αξιοποιούν εργαλεία που αναπτύχθηκαν από το Johns Hopkins Applied Physics Laboratory (APL) στο Laurel του Μέριλαντ, για να ξεμπερδέψουν την προέλευση της επιδημίας του ιού Έμπολα το 2020 στη Λαϊκή Δημοκρατία του Κονγκό (DRC). Ένα άρθρο στο The Lancet Microbe διερευνά πώς τα προηγμένα εργαλεία που αναπτύχθηκαν από την APL φέρνουν επανάσταση στην ανταπόκριση και την έρευνα σε ξέσπασμα μολυσματικών ασθενειών.

Τα τελευταία τέσσερα χρόνια, η APL ανέπτυξε σημαντικές και βελτιωμένες δυνατότητες για μια εφαρμογή που ονομάζεται ChainChecker, η οποία δημιουργήθηκε αρχικά από ερευνητές στα Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων (CDC) και Imperial College του Λονδίνου, για να βοηθήσει στην οπτικοποίηση και αξιολόγηση των αλυσίδων μετάδοσης κατά τη διάρκεια εστιών ασθενειών όπως Έμπολα.

Το ChainChecker υποστηρίζει έρευνες και ανταπόκριση επιδημιών συνδυάζοντας στοιχεία επιδημιολογικής και γονιδιωματικής αλληλουχίας για να επιτρέψει, όπως σημειώνεται στο έγγραφο, τον διερευνητικό έλεγχο γεγονότων και την επαλήθευση των πηγών πιθανής διάχυσης ζωονοσογόνων (ασθένειες που εξαπλώνονται μεταξύ ανθρώπων και ζώων) που αναφέρθηκαν από ασθενείς.

Η APL ενσωμάτωσε δεδομένα αλληλουχίας γονιδιώματος στο εργαλείο και του επέτρεψε να ανεβάζει γρήγορα και να οπτικοποιεί δεδομένα, να εντοπίζει νοσοκομειακές λοιμώξεις και να λειτουργεί σε περιβάλλοντα που δεν έχουν πρόσβαση στο διαδίκτυο. Λόγω αυτών των βελτιώσεων, το ChainChecker έχει καθιερωθεί ως νέο εργαλείο στην επιδημιολογία.

Πιο πρόσφατα, οι ερευνητές του APL επέκτεισαν τη λειτουργικότητά του, βελτιώνοντας την ικανότητά του να βοηθά τους ανταποκρινόμενους σε μελλοντικά κρούσματα, εφαρμόζοντας τους αλγόριθμους στον ιό Έμπολα καθώς και σε άλλες ασθένειες, και ενισχύοντας τη ροή εργασιών της έρευνας μέσω αξιολόγησης ποιότητας δεδομένων και ανίχνευσης ανωμαλιών.

“Τα αποτελέσματα του εργαλείου βοηθούν στην ενημέρωση των ανταποκρινόμενων σε πιο κοντά σε πραγματικό χρόνο σχετικά με πτυχές της επιδημίας, όπως οι νέοι τρόποι μετάδοσης, οι διαφορές μεταξύ των παραλλαγών του παθογόνου και η καλύτερη επιλογή μέτρων πρόληψης και ελέγχου των λοιμώξεων”, εξήγησε ο Miles Stewart, επικεφαλής του έργου. και μηχανικός λογισμικού στο Global Health Mission Area της APL και ένας από τους τρεις συν-συγγραφείς της APL στο χαρτί, μαζί με την Julia Eng και τον Abraham Rajan.

“Στη μέση μιας απάντησης, αυτοί οι τύποι ανάλυσης μπορεί να είναι εντάσεως εργασίας και πολύπλοκοι για να γίνουν πέρα από άλλες προσπάθειες για να σταματήσει το ξέσπασμα, μερικές φορές οδηγώντας στην ανακάλυψη κρίσιμων πληροφοριών μετά την ολοκλήρωση της απάντησης.” Η ΛΔΚ έχει αντιμετωπίσει 15 κρούσματα Έμπολα από το 1976. Η 11η εστία, που ανακοινώθηκε στη δυτική επαρχία Équateur της χώρας τον Ιούνιο του 2020, εμφανίστηκε ταυτόχρονα με ξέσπασμα στην ανατολική επαρχία του Βόρειου Κίβου της ΛΔΚ.

Οι επιστήμονες ήθελαν να καταλάβουν πώς αυτές και οι ταυτόχρονες επιδημίες συνδέθηκαν με την όγδοη εστία Έμπολα —το 2018, επίσης στην επαρχία Équateur— συνδυάζοντας επιδημιολογικά και γονιδιωματικά δεδομένα. «Η κατανόηση των συνδέσεων μεταξύ των κρουσμάτων Έμπολα στη Λαϊκή Δημοκρατία του Κονγκό παρουσιάζει σημαντικές προκλήσεις λόγω της τεράστιας γεωγραφικής εξάπλωσης σε ολόκληρη τη χώρα, της γενετικής ποικιλομορφίας των στελεχών του ιού Έμπολα που εμπλέκονται και του περίπλοκου κοινωνικοπολιτικού τοπίου», είπε ο Στιούαρτ.

«Η ταυτόχρονη εμφάνιση εστιών σε μακρινές επαρχίες περιπλέκει τον εντοπισμό των αλυσίδων μετάδοσης και την κατανόηση κάθε πιθανής σύνδεσης», πρόσθεσε. «Και η περιορισμένη πρόσβαση σε ορισμένες πληγείσες περιοχές, λόγω ανησυχιών για την ασφάλεια και υλικοτεχνικούς περιορισμούς, εμποδίζει τη συνολική συλλογή δεδομένων, τη δειγματοληψία και τις προσπάθειες γενετικής αλληλουχίας που είναι απαραίτητες για την ακριβή χαρτογράφηση της εξάπλωσης και της εξέλιξης του ιού».

 

Διαβάστε όλες τις τελευταίες Ειδήσεις για την υγεία από την Ελλάδα και τον Κόσμο
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο Google News και μάθετε πρώτοι όλες τις ειδήσεις
Ακολουθήστε το healthweb.gr στο κανάλι μας στο YouTube

Διαβάστε Eπίσης:

Λιβερία: Μια δεκαετία από το ξέσπασμα του Έμπολα

Τι είναι η νόσος Χ; Πώς προετοιμάζονται οι επιστήμονες για την επόμενη πανδημία

Επιστήμονες ανακάλυψαν νέα μέθοδο που χρησιμοποιεί ο ιός Έμπολα για να μολύνει τα κύτταρα

Νόσος Χ: Ίσως είναι πιο θανατηφόρα από την πανδημία Covid

svg%3E svg%3E
svg%3E
svg%3E
Περισσότερα

Ειδική επιτροπή για αξιολόγηση Βηματοδοτικών Κέντρων στο Κεντρικό Συμβούλιο Υγείας

Συγκροτήθηκε επιτροπή για την Αξιολόγηση Βηματοδοτικών Κέντρων και Κέντρων τοποθέτησης Απινιδωτών καθώς και των όρων, προϋποθέσεων και ενδείξεων, στο Κεντρικό Συμβούλιο Υγείας (Κε.Σ.Υ.) .

Μνημόνιο Συνεργασίας υπέγραψε το ΕΚΠΑ με την Google

Στην πλήρη ενεργοποίηση του Μνημονίου Συνεργασίας που υπέγραψε τον Οκτώβριο του 2024 με την Google προχωράει το Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών, εγκαινιάζοντας μία σειρά εκπαιδευτικών δράσεων που αποσκοπούν στην εμβάθυνση της γνώσης και στην αξιοποίηση της Τεχνητής Νοημοσύνης (AI) στον ακαδημαϊκό και ερευνητικό χώρο.

Συγκέντρωση χρημάτων και τροφίμων για τους σεισμοπαθείς της Μιανμάρ

Ο Ελληνικός Ερυθρός Σταυρός (E.E.Σ.), αναγνωρίζοντας την τεράστια ανθρωπιστική κρίση που έχει προκαλέσειο φονικός σεισμός που έπληξε την Μιανμάρ την Παρασκευή (28/3) και τους χιλιάδες κατοίκους της που αναγκάστηκαν να εγκαταλείψουν τις εστίες τους, απευθύνει κάλεσμα στον κόσμο για συγκέντρωση χρημάτων και τροφίμων.

Αιμοδοσία 8 Απριλίου στην Κυψέλη

Λίγο πριν το Πάσχα, το Bloode μας καλεί για προσφορά στο καθιερωμένο ραντεβού του στη Δημοτική Αγορά Κυψέλης. Τρίτη, 8 Απριλίου, ώρες 10:00 – 13:00 σας περιμένουμε όλους να σηκώσουμε τα μανίκια για τους ασθενείς του Αγίου Σάββα.

Εικοσιτέσσερα μητρώα για Σπάνια Νοσήματα το 2026

Στο Υπουργείο Υγείας έχουμε προχωρήσει σημαντικά με το κομμάτι των Μητρώων και δρομολογούνται 24 Μητρώα για Σπάνια Νοσήματα, ενώ με τον Εθνικό Ηλεκτρονικό Φάκελο Υγείας η χώρα από το τέλος του έτους και μετά θα έχει τη δυνατότητα να παράγει αυτόματα αμέτρητα μητρώα ασθενών όσα χρειάζεται για κάθε κλινική οντότητα, με υπομητρώα», λέει η Αναπληρώτρια Υπουργός Υγείας Ειρήνη Αγαπηδάκη.

Close Icon