Επιστήμονες από το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης, το KTH Βασιλικό Ινστιτούτο Τεχνολογίας, το Εργαστήριο Science for Life και το Ινστιτούτο Karolinska, Solna, Σουηδίας, συνεργάστηκαν και ανακάλυψαν ότι μεμονωμένοι όγκοι του προστάτη περιέχουν μια προηγουμένως άγνωστη σειρά γενετικών παραλλαγών. Ο καθορισμός της μετάβασης από τον καλοήθη στον κακοήθη ιστό είναι θεμελιώδους σημασίας για τη βελτίωση της έγκαιρης διάγνωσης του καρκίνου και η νέα έρευνα αποτελεί μέρος αυτής της προσπάθειας για την ενίσχυση της ιατρικής κατανόησης αυτής της διαδικασίας.
Αυτό είναι ένα σημαντικό βήμα στην ιατρική διερεύνηση των καρκίνων, καθώς η κατανόηση από ποια κύτταρα προκαλούνται ποιες περιοχές καρκίνου μπορεί να βελτιώσει την ιατρική κατανόηση του τρόπου με τον οποίο έχει αναπτυχθεί ένας όγκος.
Ένα σημαντικό ζήτημα είναι το πώς ο όγκος έχει αλλάξει γενετικά, με την πάροδο του χρόνου. Αυτό έχει προχωρήσει χρησιμοποιώντας μια νέα τεχνική που ονομάζεται χωρική μεταγραφική, η οποία επιτρέπει στους επιστήμονες να δουν ποιες γενετικές αλλαγές λαμβάνουν χώρα χωρίς να διασπάσουν τον ιστό που κοιτάζουν.
Αυτή η διαδικασία προσθέτει μια νέα διάσταση που οι ερευνητές έχουν χρησιμοποιήσει τώρα για να αποκαλύψουν ποια κύτταρα έχουν μεταλλαχθεί και πού μέσα στο οικοσύστημα ενός οργάνου.
Οι τρέχουσες τεχνικές για τη μελέτη της γενετικής των κυττάρων εντός των όγκων περιλαμβάνουν τη λήψη δείγματος από την καρκινική περιοχή και την ανάλυση του DNA αυτών των κυττάρων.
Ο περιορισμός εδώ είναι ότι πολλοί καρκίνοι, όπως ο καρκίνος του προστάτη, είναι τρισδιάστατοι, πράγμα που σημαίνει ότι οποιοδήποτε δείγμα θα έδινε μόνο ένα μικρό στιγμιότυπο του όγκου.
Για τη νέα μελέτη, οι ερευνητές χρησιμοποίησαν χωρική μεταγραφική για να δημιουργήσουν έναν χάρτη διατομής ολόκληρου του προστάτη, συμπεριλαμβανομένων περιοχών υγιών και καρκινικών κυττάρων.
Έδειξαν ότι ομαδοποιώντας κύτταρα σύμφωνα με παρόμοια γενετική ταυτότητα, έμειναν έκπληκτοι βλέποντας περιοχές υποτιθέμενου υγιούς ιστού που είχαν ήδη πολλά από τα γενετικά χαρακτηριστικά του καρκίνου.
Αυτό το εύρημα ήταν εκπληκτικό τόσο λόγω της γενετικής μεταβλητότητας εντός του ιστού όσο και του μεγάλου αριθμού κυττάρων που θα θεωρούνταν υγιή, αλλά που περιείχαν μεταλλάξεις που συνήθως ταυτίζονται με καρκινικά κύτταρα.
Ένα βασικό εύρημα είναι ότι τα συμβάντα αριθμού αντιγράφων που θεωρούνταν προηγουμένως ότι συνδέονται ειδικά με τον καρκίνο, στην πραγματικότητα υπάρχουν ήδη στον καλοήθη ιστό.
Αυτό έχει μεγάλες συνέπειες για τη διάγνωση και επίσης πιθανώς για την απόφαση ποια τμήματα ενός καρκίνου χρειάζονται θεραπεία.
Επιπλέον, οι απόψεις υψηλής ανάλυσης που επιτυγχάνονται θα πρέπει να επηρεάσουν τον τρόπο αντιμετώπισης πολύπλοκων οικοσυστημάτων όπως ο καρκίνος. Αυτό προκύπτει από την ανάλυση περισσότερων από 150.000 περιοχών σε τρεις προστάτες, δύο καρκίνους του μαστού, κάποιο δέρμα, έναν λεμφαδένα και κάποιο εγκεφαλικό ιστό και στη συνέχεια αναπτύσσοντας έναν αλγόριθμο για την παρακολούθηση ομάδων κυττάρων με παρόμοιες γενετικές αλλαγές.
Η εξέλιξη εμφανίζεται στο περιοδικό Nature, με τίτλο «Χωρικές αλλοιώσεις αριθμού κλωνικών αντιγράφων σε καλοήθεις και κακοήθεις ιστούς.