Έρευνα Κορωνοϊός: Παραλλαγές του κορωνοϊού εμφανίζονται σε διάφορα μέρη του κόσμου, πολλές από τις οποίες εξαπλώνονται με ανησυχητική ταχύτητα. Μία μεταδοτική παραλλαγή είναι η παραλλαγή της Νότιας Αφρικής ή SA, που προσδιορίζεται από μια διεθνή ομάδα ερευνητών, συμπεριλαμβανομένων βιοϊατρικών επιστημόνων από το Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια, Riverside.
“Οι νέες παραλλαγές SARS-CoV-2-19 είναι τα επόμενα νέα σύνορα”, δήλωσε ο Adam Godzik, καθηγητής βιοϊατρικών επιστημών στην Ιατρική Σχολή UC Riverside και μέλος της ερευνητικής ομάδας που έκανε την ανακάλυψη.
“Από αυτά, τα στελέχη SA και τα της Βραζιλίας είναι τα πιο ανησυχητικά. Έχουν μεταλλάξεις που τα καθιστούν ανθεκτικά στα αντισώματα που παράγουμε με υπάρχοντα εμβόλια.
Πιστεύεται συνήθως ότι είμαστε σε μια σφιχτή φυλή: Ακόμα και αν εμβολιάζαμε γρήγορα τους ανθρώπους και καθαρίζαμε την πανδημία, νέες παραλλαγές θα κυριαρχούσαν σε σημείο που όλα τα εμβόλια COVID-19 θα ήταν αναποτελεσματικά.”
Οι Godzik και Arghavan Alisoltani-Dehkordi, μεταδιδακτορικός ερευνητής που εντάχθηκε στο εργαστήριό του πριν από δύο χρόνια, βοήθησαν στον χαρακτηρισμό της νέας παραλλαγής SA, παρέχοντας τη δομή της πρωτεϊνικής ακίδας, χρησιμοποιώντας προσομοιώσεις υπολογιστών.
Τα αποτελέσματα της μελέτης εμφανίζονται σήμερα στο Nature.
Η Alisoltani-Dehkordi, που ήταν μεταδιδακτορικός συνεργάτης στο Πανεπιστήμιο του Κέιπ Τάουν της Νότιας Αφρικής πριν ενταχθεί στο UCR, ανέφερε ότι ερευνητικές ομάδες στο Πανεπιστήμιο του KwaZulu-Natal στη Νότια Αφρική και στο Πανεπιστήμιο του Κέιπ Τάουν ανακάλυψαν τη νέα γενεαλογία – ή παραλλαγή από τον SARS-CoV-2, τον ιό που προκαλεί τη νόσο COVID-19, από δείγματα που συλλέχθηκαν μεταξύ 15 Οκτωβρίου και 25 Νοεμβρίου 2020, σε τρεις επαρχίες της Νότιας Αφρικής.
Στις αρχές Νοεμβρίου, αυτή η παραλλαγή έγινε γρήγορα η κυρίαρχη παραλλαγή σε δείγματα από δύο επαρχίες.
“Κάθε παραλλαγή SARS-CoV-2 έχει συγκεκριμένες μεταλλάξεις που την ορίζουν”, δήλωσε ο Alisoltani-Dehkordi.
“Ο καθηγητής Godzik και εγώ χρησιμοποιούσαμε τη μοντελοποίηση υπολογιστών για να προτείνουμε πιθανές δομικές και λειτουργικές συνέπειες των μεταλλάξεων πρωτεϊνών αιχμής στη γενεαλογία SA. Η ανάλυσή μας, που επιβεβαιώθηκε και από πολλές άλλες ερευνητικές ομάδες, δείχνει ότι ορισμένες από τις μεταλλάξεις ενδέχεται να οδηγήσουν σε μεγαλύτερη μεταδοτικότητα του ιού και σε μια ασθενέστερη ανοσοαπόκριση.
” Η παραλλαγή SA έχει εντοπιστεί σε τουλάχιστον 40 χώρες, συμπεριλαμβανομένων των Ηνωμένων Πολιτειών. “Αυτή η παραλλαγή πιθανότατα εξαπλώνεται σε περιοχές όπου δεν έχει προσδιοριστεί αλληλουχία και, ως εκ τούτου, δεν είναι αναγνωρίσιμη”, δήλωσε ο Godzik. “Στις ΗΠΑ, η αλληλουχία εξακολουθεί να είναι μια αργή διαδικασία. Σε πολλά μέρη της χώρας, συμπεριλαμβανομένου του Riverside, δεν έχουμε καμία απολύτως πληροφορία σχετικά με τις παραλλαγές.”
Η αρχική έρευνα σχετικά με την παραλλαγή SA έδειξε ότι μπορεί να είναι ανθεκτική στα αντισώματα, πράγμα που θα μπορούσε να μειώσει την αποτελεσματικότητα των εμβολίων. “Τότε έλαβε ένα υψηλό επίπεδο ενδιαφέροντος”, δήλωσε ο Γκόντζιτς. “Μεταγενέστερη έρευνα επιβεβαίωσε ότι είναι ανθεκτική στα εμβόλια και εξαπλώνεται.
Η Νότια Αφρική κάνει καλή δουλειά, ωστόσο, στον έλεγχο της παραλλαγής μέσω της απομόνωσης και άλλων μέτρων.”
Όλες οι πρόσφατα εμφανιζόμενες παραλλαγές SARS-CoV-2 στο Ηνωμένο Βασίλειο, τη Νότια Αφρική, τη Βραζιλία και την Καλιφόρνια δείχνουν κοινές μεταλλακτικές υπογραφές. Αλλά κάθε μία από αυτές τις παραλλαγές έχει επίσης ένα μοναδικό σύνολο μεταλλάξεων.
Για παράδειγμα, οι παραλλαγές SA και Βραζιλίας έχουν δύο μοναδικές μεταλλάξεις στις πρωτεΐνες ακίδων K417N και E484K, αντίστοιχα. “Τα προκαταρκτικά μας ευρήματα δείχνουν ότι ορισμένες από τις μεταλλάξεις spike μπορεί να σχετίζονται με αυξημένη μεταδοτικότητα της παραλλαγής SA”, δήλωσε ο Alisoltani-Dehkordi. “Ωστόσο, η πλήρης σημασία των μεταλλάξεων ακίδων και άλλων γονιδιωμάτων σε αυτήν τη νέα γενεαλογία δεν έχει ακόμη καθοριστεί.
Πρέπει να τονιστεί ότι δεν έχουμε αρκετά στοιχεία που να επιβεβαιώνουν την υψηλότερη εξέλιξη της νόσου, τη σοβαρότητα ή το ποσοστό θνησιμότητας που σχετίζεται με την ΑΕ. γενεαλογία σε σύγκριση με άλλες γενεαλογίες. Αλλά η υψηλή μεταδοτικότητα και η ασυνήθιστη απόκλιση της γενεαλογίας SA και άλλων πρόσφατα εμφανιζόμενων γενεών σε σύγκριση με τον άγριο τύπο δημιουργεί μεγάλη ζήτηση για τη συστηματική παρακολούθηση των στελεχών SARS-CoV-2 και την έγκαιρη ανίχνευση παραλλαγών πριν γυρίσουν σε εστίες. ”
Ο Godzik εξήγησε ότι δεν υπάρχει κανένας ιός κορωνοϊος. Αντ’ αυτού, υπάρχει ένας πληθυσμός ιών που συνεχώς εξελίσσονται. Οι παραλλαγές, οι οποίες εξελίσσονται, αποκτούν μεταλλάξεις και θα μπορούσαν να υποστούν ιογενή διαφυγή ανά πάσα στιγμή. “Είναι δύσκολο να πούμε ότι υπάρχει μόνο μία παραλλαγή SA”, είπε.
“Ένας τρόπος να το καταλάβεις είναι να φανταστείς ότι αυτή η παραλλαγή είναι ο κύριος κλάδος ενός δέντρου, ο οποίος έχει πολλά μικρότερα κλαδιά. Μερικά από αυτά τα μικρότερα μπορεί να αναπτυχθούν γρηγορότερα από άλλα και να πάρουν μεγαλύτερη σημασία. Αυτή η δυναμική διαδικασία είναι δύσκολο να προβλεφθεί.”
Ο Godzik προβλέπει ότι η COVID-19 θα είναι μια συνεχής παρουσία στη ζωή μας, σαν τη γρίπη. “Χρειάζονται έξι μήνες για την ανάπτυξη εμβολίου κατά της γρίπης”, είπε. “Τα μοντέλα προβλέπουν την εξέλιξη του ιού της γρίπης και τα εμβόλια παράγονται πριν εμφανιστούν οι παραλλαγές. Εάν οι προβλέψεις είναι καλές, τα εμβόλια λειτουργούν. Εάν χάσουν, ακολουθεί μια βαριά περίοδος γρίπης.
Έτσι θα συμπεριφερθεί πιθανώς η COVID-19. Θα καταβληθεί πολλή προσπάθεια για την πρόβλεψη τού τι θα συμβεί τον επόμενο χρόνο, τα εμβόλια θα ενημερώνονται τότε και οι άνθρωποι θα πρέπει να κάνουν μια αναμνηστική λήψη.”