Σε μια πρόσφατη μελέτη που δημοσιεύτηκε στον διακομιστή προεκτύπωσης medRxiv, οι ερευνητές περιέγραψαν τη δεύτερη ενημέρωση σχετικά με τη μελέτη της ανθρώπινης γενετικής αρχιτεκτονικής σχετικά με την επίδραση της νόσου COVID-19. Σε παγκόσμιο επίπεδο, έχουν αναφερθεί συνολικά 651,9 εκατομμύρια επιβεβαιωμένα κρούσματα COVID-19, συμπεριλαμβανομένων 6,6 εκατομμυρίων θανάτων.
Μελέτες έχουν διερευνήσει τις διάφορες πτυχές της λοίμωξης από το σοβαρό οξύ αναπνευστικό σύνδρομο από τον κορωνοϊό 2 (SARS-CoV-2) και τον αντίκτυπό του στον ανθρώπινο οργανισμό για την καταπολέμηση της νοσηρότητας που προκαλείται από την COVID-19. Η κατανόηση της λειτουργίας των γενετικών παραγόντων του ξενιστή που εμπλέκονται στην ευαισθησία και τη σοβαρότητα της COVID-19 είναι απαραίτητη για την αποκάλυψη των υποκείμενων μηχανισμών που μπορούν να επηρεάσουν τις ανεπιθύμητες εκβάσεις της νόσου και να διευκολύνουν την ανάπτυξη νέων φαρμάκων.
Σχετικά με τη μελέτη
Στην παρούσα μελέτη, οι ερευνητές παρουσίασαν τη δεύτερη ενημέρωση της μελέτης συσχέτισης σε όλο το γονιδίωμα (GWAS) που σχετίζεται με την ευαισθησία και τη σοβαρότητα της λοίμωξης SARS-CoV-2 που προέρχεται από τη γενετική πρωτοβουλία ξενιστή COVID-19 (HGI). Η ομάδα πραγματοποίησε τη μετα-ανάλυση τριών φαινοτύπων που σημειώθηκαν σε περισσότερες από 82 μελέτες που ελήφθησαν από 35 χώρες, οι οποίες περιελάμβαναν 36 μελέτες με μη ευρωπαϊκή καταγωγή. Οι τρεις φαινότυποι περιελάμβαναν κρίσιμη ασθένεια, νοσηλεία και μόλυνση από SARS-CoV-2.
Οι περισσότερες από αυτές τις μελέτες ελήφθησαν πριν από την ευρεία διαθεσιμότητα των εμβολίων SARS-CoV-2. Η ομάδα συνέκρινε το μέγεθος του αποτελέσματος και τη στατιστική σημασία μεταξύ των προηγούμενων και των τρεχουσών αναλύσεων. Χρησιμοποιήθηκαν μοντέλα δύο τάξεων Bayesian για την κατηγοριοποίηση των τόπων ως με υψηλότερη πιθανότητα εμπλοκής είτε στη σοβαρότητα είτε στην ευαισθησία της μόλυνσης. Επιπλέον, η ομάδα χαρτογράφησε τα υποψήφια αιτιολογικά γονίδια σε βιολογικές οδούς και πραγματοποίησε μια αξιολόγηση συσχέτισης σε όλο το φαινόμενο.
Αποτελέσματα
Τα αποτελέσματα της μελέτης βρήκαν 21, 40 και 30 τόπους που αντιστοιχούν σε λοίμωξη SARS-CoV-2, νοσηλεία και κρίσιμη ασθένεια, αντίστοιχα. Σχεδόν 51 σημαντικοί τόποι σε όλο το γονιδίωμα σημειώθηκαν για τους τρεις φαινότυπους, προσθέτοντας 28 αξιοσημείωτους τόπους στους 23 εντοπισμένους προηγουμένως τόπους από την COVID-19 HGI. Μετά την προσαρμογή του αριθμού των φαινοτύπων που αξιολογήθηκαν, 46 τόποι παρέμειναν σημαντικοί.
Το μοντέλο Bayesian έδειξε ότι 366 τόποι ήταν σημαντικά πιο πιθανό να επηρεάσουν τη σοβαρότητα της νόσου και τη νοσηλεία. Εννέα τόποι θα μπορούσαν να επηρεάσουν την ευαισθησία στην COVID-19, ενώ έξι τόποι δεν μπορούσαν να κατηγοριοποιηθούν. Η ομάδα σημείωσε ότι ο τόπος 1q22 είχε αξιοσημείωτη ετερογένεια στο μέγεθος του αποτελέσματος μεταξύ των προγόνων, ενώ ο προηγουμένως σημειωμένος ετερογενής τόπος FOXP4 εμφάνιζε παρόμοιο επίπεδο σημασίας με αυτό που ανιχνεύτηκε προηγουμένως.
Συμπέρασμα
Τα ευρήματα της μελέτης έδειξαν ότι η δεύτερη ενημέρωση του GWAS ενίσχυσε την τρέχουσα κατανόηση της γενετικής του ξενιστή που εμπλέκεται στη σοβαρότητα και την ευαισθησία της COVID-19 ανιχνεύοντας επιπλέον 28 τόπους. Αυτός ο βελτιωμένος αριθμός τόπων διευκολύνει τη χαρτογράφηση των γονιδίων σε αντίστοιχες οδούς που εμπλέκονται στην είσοδο του SARS-CoV-2, στην άμυνα στη βλέννα των αεραγωγών και στην απόκριση του ανοσοποιητικού συστήματος. Οι ερευνητές πιστεύουν ότι απαιτείται περαιτέρω μελέτη για την αξιολόγηση του τρόπου με τον οποίο οι τόποι σοβαρότητας και ευαισθησίας της COVID-19 χαρτογραφήθηκαν. Τα μονοπάτια παρέχουν πληροφορίες σχετικά με τον αντίκτυπο της COVID-19 στην ανθρώπινη γενετική αρχιτεκτονική.