Τρεις ημέρες πριν από την Ημέρα των Ευχαριστιών, ένα αεροπλάνο με επιβάτες από τη Νότια Αφρική προσγειώθηκε στο Σαν Φρανσίσκο. Μία από αυτές ήταν μια γυναίκα που βρισκόταν στα αρχικά στάδια μόλυνσης από την Covid-19, αν και δεν θα το ήξερε για σχεδόν άλλη μια εβδομάδα. Έτυχε να είναι την ίδια μέρα που επιστήμονες 10.000 μίλια μακριά στη Μποτσουάνα και τη Νότια Αφρική άρχισαν να ειδοποιούν τον κόσμο για μια νέα και εξαιρετικά μεταλλαγμένη εκδοχή του ιού που προκαλεί την Covid-19. Πώς εμπλέκεται η επιδημιολογία με βάση τα λύματα;
Η Alexandria Boehm, καθηγήτρια στο Πανεπιστήμιο του Στάνφορντ, διάβασε για το συνηθισμένο μοτίβο μεταλλάξεων στην παραλλαγή που δεν έχει ακόμη ονομαστεί και ξεκίνησε τη δράση.
Για περισσότερο από ένα χρόνο, η Boehm και η ομάδα της από 45 άτομα στο Sewer Coronavirus Alert Network ή SCAN, συλλέγουν και δοκιμάζουν καθημερινά δείγματα λάσπης από μονάδες επεξεργασίας λυμάτων στη Βόρεια Καλιφόρνια, αναζητώντας θραύσματα του νέου κορωνοϊού.
Η επιδημιολογία με βάση τα λύματα έχει αποδειχθεί τόσο αξιόπιστη σε δεκάδες πιλοτικά έργα στις ΗΠΑ που η κυβέρνηση έχει επενδύσει εκατομμύρια για να δημιουργήσει το Εθνικό Σύστημα Εποπτείας Λυμάτων ή NWSS, ένα δίκτυο 400 τοποθεσιών δοκιμών σε 19 πολιτείες που συντονίζεται από την Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων των ΗΠΑ. Το SCAN της Boehm είναι μέρος αυτού του δικτύου, το οποίο λειτουργεί αθόρυβα στα παρασκήνια, δημιουργώντας δεδομένα για υπηρεσίες δημόσιας υγείας σε όλη τη χώρα, από τον Σεπτέμβριο του 2020.
Για πρώτη φορά, τα CDC θα δημοσιεύσουν δεδομένα που εξετάζουν πόση ποσότητα κορωνοϊού εμφανίζεται στα λύματα της χώρας. Θα προσθέσει αυτά τα δεδομένα δοκιμών στον πίνακα ελέγχου Covid-19. Οι δοκιμές δείχνουν ότι υπήρξε μείωση στην ποσότητα του ιού στα δύο τρίτα των 400 τοποθεσιών του NWSS από τα επίπεδα που μετρήθηκαν πριν από 15 ημέρες, σύμφωνα με έναν αξιωματούχο των CDC που γνωρίζει τον σχεδιασμό. Περισσότεροι από 500 ιστότοποι θα αρχίσουν να υποβάλλουν δεδομένα τις επόμενες εβδομάδες, λένε τα CDC. Μια ενημέρωση μέσων ενημέρωσης για το σύστημα παρακολούθησης έχει προγραμματιστεί για την Παρασκευή.
Δεδομένα από οπουδήποτε με σύνδεση αποχέτευσης
Ο SARS-CoV-2, ο ιός που προκαλεί την Covid-19, είναι εγκλωβισμένος. Αφού εισβάλει στο σώμα μας και αρχίσει να κλωνοποιείται με μανία, μερικά από αυτά τα αντίγραφα χύνονται στα έντερά μας, όπου τα λιπαρά μέρη του ιού κολλάνε στα λίπη στα κόπρανα. Όταν αφοδεύουμε, γενετικό υλικό από τον ιό ξεχύνεται στην τουαλέτα στο ρεύμα των λυμάτων, όπου μπορεί να ανιχνευθεί με τα ίδια είδη δοκιμών που χρησιμοποιούν τα εργαστήρια για την ανίχνευση του ιού από ρινικά επιχρίσματα: δοκιμές αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης σε πραγματικό χρόνο ή RT- PCR. Αυτό το είδος δοκιμών είναι εξαιρετικά ευαίσθητο. Μπορεί να εντοπίσει την παρουσία του ιού όταν μόνο ένα άτομο από τα 100.000 σε μια δεδομένη περιοχή ή λεκάνη αποχέτευσης έχει μολυνθεί.
Και επειδή οι δοκιμές λυμάτων δεν εξαρτώνται από το να συνειδητοποιήσουν οι άνθρωποι ότι είναι άρρωστοι και να αναζητήσουν μια εξέταση ή ακόμα και να έχουν συμπτώματα, είναι συχνά η πρώτη προειδοποίηση που έχει μια κοινότητα ότι το κύμα λοιμώξεων Covid-19 βρίσκεται στο δρόμο. Τα CDC εκτιμούν ότι χρειάζονται πέντε έως επτά ημέρες μετά την τουαλέτα για να ληφθούν τα δεδομένα λυμάτων στον εντοπισμό της COVID και τα δείγματα συνήθως γίνονται θετικά σε μια περιοχή τέσσερις έως έξι ημέρες πριν εμφανιστούν κλινικά περιστατικά. “Εφόσον οι άνθρωποι χρησιμοποιούν μια τουαλέτα που είναι συνδεδεμένη με αποχέτευση, μπορούμε να λάβουμε πληροφορίες για αυτές τις περιπτώσεις σε αυτήν την κοινότητα”, δήλωσε η Amy Kirby, μικροβιολόγος των CDC που ηγείται του έργου NWSS.