Ένας από τους πιο διαδεδομένους μύθους είναι ότι ο αυτισμός προκαλείται από αντιεμβολιαστικές θεωρίες. Συγκεκριμένα, υπάρχει η πεποίθηση ότι τα εμβόλια, ειδικά το εμβόλιο για την ιλαρά, την παρωτίτιδα και την ερυθρά (MMR), μπορεί να προκαλέσουν αυτισμό. Ωστόσο, αυτή η θεωρία διαψεύστηκε πλήρως από πολυάριθμες μελέτες και ερευνες. Ο αυστραλός γιατρός Andrew Wakefield, που δημοσίευσε μια ψευδή μελέτη το 1998, ανακάλεσε την έρευνά του και αποδείχθηκε ότι η μελέτη ήταν παραποιημένη. Επιστημονικές έρευνες έχουν επανειλημμένα δείξει ότι δεν υπάρχει σύνδεση μεταξύ των εμβολίων και του αυτισμού.
Ένας άλλος μύθος αφορά την γονική ευθύνη. Υπάρχουν λανθασμένες αντιλήψεις ότι οι γονείς, ιδιαίτερα οι μητέρες, μπορεί να είναι υπεύθυνοι για την ανάπτυξη του αυτισμού λόγω της «συναισθηματικής αποστασιοποίησης» ή των «λάθος γονεϊκών μεθόδων». Αυτές οι θεωρίες δεν έχουν καμία επιστημονική βάση και είναι παραπλανητικές. Ο αυτισμός είναι γενετικής φύσης και συνδέεται με την αλληλεπίδραση γενετικών και περιβαλλοντικών παραμέτρων, όχι με την ανατροφή.
Επίσης, υπάρχει ο μύθος ότι ο αυτισμός προκαλείται από κακή διατροφή ή άλλες εξωτερικές περιβαλλοντικές συνθήκες, όπως η ρύπανση ή η έκθεση σε τοξικές χημικές ουσίες. Αν και η διατροφή και το περιβάλλον μπορεί να επηρεάσουν τη γενική υγεία και την ανάπτυξη του παιδιού, δεν υπάρχουν αποδείξεις ότι προκαλούν άμεσα αυτισμό.
Ο αυτισμός είναι μια σύνθετη διαταραχή με πολλές αιτίες και παράγοντες, και η κατανόηση των πραγματικών αιτίων του απαιτεί συνεχιζόμενη επιστημονική έρευνα.